JetPoint. Биоинформатика

Лекция / семинар сайт события http://jetpoint.timepad.ru/event/58594/

Добавить в календарь:
Поделиться:

Компания JetBrains запускает серию технологических семинаров JetPoint для разработчиков программного обеспечения. На JetPoint можно узнать про алгоритмические, вычислительные и технологические аспекты разных направлений Computer Science, а также познакомиться со специалистами из разных областей разработки программного обеспечения.

В рамках технологических встреч JetPoint в петербургском офисе компании JetBrains состоится семинар по Биоинформатике, одному из самых быстрорастущих разделов Computer Science.

Биоинформатики исследуют специфические алгоритмы и методы анализа больших объёмов данных, работая преимущественно с геномными и белковыми последовательностями. Благодаря этой области науки учёные смогли прочитать геном человека, создать искусственную бактерию и даже вылечить некоторые виды рака.

Докладчики: Николай Вяххи (Лаборатория алгоритмической биологии СПб АУ РАН) расскажет про базовые определения из биоинформатики и молекулярной биологии и приведёт краткий обзор разделов.

Сергей Нурк и Антон Банкевич (Лаборатория алгоритмической биологии СПб АУ РАН) подробно расскажут о задаче секвенирования и сборки генома, и о том, как устроен геномный ассемблер SPAdes.

Олег Шпынов (JetBrains) расскажет про эпигенетику, технологии и данные, про механизмы эпигенетических модификаций на примере растений, а также про биоинформатический проект в JetBrains: его цели, результаты, проблемы и текущие задачи.

Предварительных знаний в биологии не требуется, но общее понимание геномики и генетики будет полезным.

Николай Вяххи

Николай окончил Математико –механический факультет СПбГУ в 2007 году. В настоящее время является сотрудником Лаборатории алгоритмической биологии СПбАУ РАН, руководит магистерской программой по биоинформатике и курсами по биоинформатике в АУ РАН.

Как попал в биоинформатику:

«Я интересовался алгоритмами и олимпиадными задачками по программированию, интересовался разными алгоритмами на строках, а биоинформатика — это по большей части обработка строк»

Twitter  Vyahhi

Список тем:

·         базовые определения из биоинформатики и молекулярной биологии

·         краткий обзор разделов биоинформатики

 

Сергей Нурк

Сергей окончил Математико –механический факультет СПбГУ в 2011 году. В настоящее время работает младшим научным сотрудником Лаборатории вычислительной биологии Санкт-Петербургского Академического Университета. В данный момент является аспирантом Академического Университета. До лаборатории работал в петербургском Яндексе.

 

Как попал в биоинформатику:

«Как и практически все мои коллеги, о биоинформатике узнал от Николая Вяххи.»

 

 

Антон Банкевич

Антон выпускник кафедры алгебры  Математико –механического факультета СПбГУ. Специализируется в области теории графов. Работает в  Лаборатории алгоритмической биологии СПбАУ РАН.

Как попал в биоинформатику:

«Про биоинформатику впервые услышал, когда меня пригласили работать в лаборатории»

Список тем:

·         задача сборки генома и существующие подходы к её решению

·         как устроен геномный ассемблер ЛАБ СПбАУ РАН и его разработка

·         сравнительный анализ генома и сборка метагеномных данных

 

Олег Шпынов

Олег выпускник Математико –механического факультета СПбГУ . В настоящее время работает в компании JetBrains над внутренним биоинформатическим исследовательским проектом.

Как попал в биоинформатику:

«Я попал в биоинформатику в рамках курсов, когда проходил практику в лабораториях СПбГУ и Алкор-Био»
 

Список тем:

  • Эпигенетика - определение, свойства, функции, виды.
  • Способы измерения, технологии.
  • Фундаментальные механизмы эпигенетических модификаций на примере растений.
  • Цели нашего проекта, результаты, проблемы, текущие задачи.
Во весь экран
Показать еще

Комментарии (0):

Оставлять комментарии могут только зарегистрированные пользователи

Для получения embed кода необходимо кликнуть правой
кнопкой мыши на видео и выбрать пункт меню
'Сгенерировать HTML код'

Забыли пароль? Регистрация